Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cnih4Q9CX13 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih4Q9CX13 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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