Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
NubplQ9CWD8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms