Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smim3Q99PE5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim3Q99PE5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms