Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hps4Q99KG7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hps4Q99KG7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hps4Q99KG7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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