Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Tmed9Q99KF1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms