Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lims1Q99JW4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms