Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Csmd1Q923L3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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