Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms