Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc3Q91W40 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms