Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttc39cQ8VE09 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms