Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms1Q8VCQ6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms1Q8VCQ6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms1Q8VCQ6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms1Q8VCQ6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms1Q8VCQ6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms1Q8VCQ6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms1Q8VCQ6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sgms1Q8VCQ6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sgms1Q8VCQ6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms