Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Dnajc28Q8VCE1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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