Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Vmn1r200Q8R281 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r200Q8R281 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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