Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SrrdQ8K2M3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms