Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim35Q8C006 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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