Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usp1Q8BJQ2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp1Q8BJQ2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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