Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm12269-201ENSMUST00000122273 717 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClmQ7TSN2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms