Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Dsg1cQ7TSF0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms