Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nphp3Q7TNH6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms