Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6aQ78XR0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6aQ78XR0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6aQ78XR0 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6aQ78XR0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6aQ78XR0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6aQ78XR0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6aQ78XR0 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6aQ78XR0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc6aQ78XR0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trappc6aQ78XR0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6aQ78XR0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms