Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sys1Q78S06 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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