Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Timd4Q6U7R4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Timd4Q6U7R4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Timd4Q6U7R4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Timd4Q6U7R4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Timd4Q6U7R4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Timd4Q6U7R4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Timd4Q6U7R4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Timd4Q6U7R4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms