Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chd4Q6PDQ2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chd4Q6PDQ2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms