Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smchd1Q6P5D8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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