Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc3c1Q6DFV6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fndc3c1Q6DFV6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Fndc3c1Q6DFV6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc3c1Q6DFV6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc3c1Q6DFV6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Fndc3c1Q6DFV6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc3c1Q6DFV6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc3c1Q6DFV6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Fndc3c1Q6DFV6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Fndc3c1Q6DFV6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fndc3c1Q6DFV6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Fndc3c1Q6DFV6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Fndc3c1Q6DFV6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Fndc3c1Q6DFV6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Fndc3c1Q6DFV6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Fndc3c1Q6DFV6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Fndc3c1Q6DFV6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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