Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc18Q640L5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Ccdc18Q640L5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Ccdc18Q640L5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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