Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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PcolceQ61398 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PcolceQ61398 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms