Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AcanQ61282 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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