Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms