Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms