Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tbc1d1Q60949 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms