Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Slc6a4Q60857 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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