Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf608Q56A10 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf608Q56A10 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms