Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms