Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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