Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms