Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zfp444Q3TDV8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp444Q3TDV8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms