Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim63Q38HM4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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