Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trim71Q1PSW8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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