Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cers3Q1A3B0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms