Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Znf541Q0GGX2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms