Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rbp2Q08652 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms