Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Calb2Q08331 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms