Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
F13bQ07968 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms