Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms