Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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