Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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NfiaQ02780 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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NfiaQ02780 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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NfiaQ02780 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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NfiaQ02780 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NfiaQ02780 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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NfiaQ02780 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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NfiaQ02780 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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NfiaQ02780 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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NfiaQ02780 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NfiaQ02780 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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