Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Gjb4Q02738 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms