Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms