Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms